TOP10
| ランキング | タイトル | 売上(万本) | メーカー | 発売日 | |
| １ |  | Newスーパーマリオブラザーズ | 648 | 任天堂 | 2006年05月25日 |
| ２ |   | ポケットモンスター ダイヤモンド／ポケットモンスター パール | 585 | ポケモン/任天堂 | 2006年09月28日 |
| ３ |   | ポケットモンスター ブラック／ホワイト | 553 | 任天堂 | 2010年09月18日 |
| ４ |  | おいでよ どうぶつの森 | 533 | 任天堂 | 2005年11月23日 |
| ５ |  | 東北大学未来科学技術共同研究センター川島隆太教授監修 もっと脳を鍛える大人のDSトレーニング | 510 | 任天堂 | 2005年12月29日 |
| ６ |  | ドラゴンクエストIX 星空の守り人 | 430 | スクウェア･エニックス | 2009年07月11日 |
| ７ |  | マリオカートDS | 401 | 任天堂 | 2005年12月08日 |
| ８ |  | 東北大学未来科学技術共同研究センター川島隆太教授監修 脳を鍛える大人のDSトレーニング | 396 | 任天堂 | 2005年05月19日 |
| ９ |   | ポケットモンスター ハートゴールド／ポケットモンスター ソウルシルバー | 395 | ポケモン/任天堂 | 2009年09月12日 |
| 10 |  | トモダチコレクション | 375 | 任天堂 | 2009年06月18日 |
10位～50位
| ランキング | タイトル | 売上(万本) | メーカー | 発売日 | |
| 11 |   | ポケットモンスター ブラック2／ポケットモンスター ホワイト2 | 301.2 | ポケモン/任天堂 | 2000年12月14日 |
| 12 |  | ポケットモンスター プラチナ | 264 | 任天堂 | 2008年09月13日 |
| 13 |  | 英語が苦手な大人のDSトレーニング えいご漬け | 236 | 任天堂 | 2006年01月26日 |
| 14 |  | マリオパーティDS | 215 | 任天堂 | 2007年11月08日 |
| 15 |    | nintendogs(ニンテンドッグス) 柴＆フレンズ／ダックス＆フレンズ／チワワ＆フレンズ | 212 | 任天堂 | 2005年04月21日 |
| 16 |  | リズム天国ゴールド | 197 | 任天堂 | 2008年07月31日 |
| 17 |  | ドラゴンクエストモンスターズ ジョーカー2 | 180 | スクウェア･エニックス | 2010年04月28日 |
| 18 |  | 監修日本常識力検定協会 いまさら人には聞けない大人の常識力トレーニングDS | 168 | 任天堂 | 2006年10月26日 |
| 19 |  | やわらかあたま塾 | 164 | 任天堂 | 2005年06月30日 |
| 20 |   | ポケモン不思議のダンジョン 時の探検隊 ／闇の探検隊 | 158.1 | ポケモン/任天堂 | 2007年09月13日 |
| 21 |  | ドラゴンクエストモンスターズ ジョーカー | 150 | スクウェア･エニックス | 2006年12月28日 |
| 22 |  | テトリスDS | 138 | 任天堂 | 2006年04月27日 |
| 23 |  | ドラゴンクエストVI 幻の大地 | 130 | スクウェア･エニックス | 2010年01月28日 |
| 24 |  | ドラゴンクエストV 天空の花嫁 | 130 | スクウェア･エニックス | 2008年07月17日 |
| 25 |  | スーパーマリオ64DS | 129 | 任天堂 | 2004年12月02日 |
| 26 |  | 星のカービィ ウルトラスーパーデラックス | 127 | 任天堂 | 2008年11月06日 |
| 27 |  | さわるメイドインワリオ | 126 | 任天堂 | 2004年12月02日 |
| 28 |  | ドラゴンクエストIV 導かれし者たち | 121.4 | スクウェア･エニックス | 2007年11月22日 |
| 29 |   | イナズマイレブン2 脅威の侵略者 ファイア／ブリザード | 119 | レベルファイブ | 2009年10月01日 |
| 30 |  | 星のカービィ 参上！ドロッチェ団 | 118 | 任天堂 | 2006年11月02日 |
| 31 |  | ヨッシーアイランドDS | 112 | 任天堂 | 2007年03月08日 |
| 32 |  | たまごっちのプチプチおみせっち | 111 | バンダイ | 2005年09月15日 |
| 33 |  | オシャレ魔女ラブandベリー～DSコレクション～ | 111 | セガ | 2006年11月22日 |
| 34 |   | イナズマイレブン3 世界への挑戦!! スパーク／ボンバー | 111 | レベルファイブ | 2010年07月01日 |
| 35 |  | ファイナルファンタジーIII | 111 | スクウェア･エニックス | 2006年08月24日 |
| 36 |  | しゃべる！DSお料理ナビ | 101 | 任天堂 | 2006年07月20日 |
| 37 |  | レイトン教授と不思議な町 | 101 | レベルファイブ | 2007年02月15日 |
| 38 |  | 見る力を実践で鍛えるDS眼力トレーニング | 101 | 任天堂 | 2007年05月31日 |
| 39 |  | レイトン教授と悪魔の箱 | 93.9 | レベルファイブ | 2007年11月29日 |
| 40 |  | ゼルダの伝説 夢幻の砂時計 | 90.2 | 任天堂 | 2007年06月23日 |
| 41 |  | わがままファッション ガールズモード | 89.1 | 任天堂 | 2008年10月23日 |
| 42 |  | レイトン教授と最後の時間旅行 | 86.8 | レベルファイブ | 2008年11月27日 |
| 43 |  | JUMP ULTIMATE STARS | 78.9 | 任天堂 | 2006年11月23日 |
| 44 |  | たまごっちのプチプチおみせっち ごひーきに | 78 | バンダイ | 2006年07月27日 |
| 45 |  | 英語が苦手な大人のDSトレーニング もっとえいご漬け | 76.7 | 任天堂 | 2007年03月29日 |
| 46 |  | ポケモン不思議のダンジョン 青の救助隊 | 76.1 | ポケモン/任天堂 | 2005年11月17日 |
| 47 |  | マリオ＆ルイージRPG3!!! | 74.5 | 任天堂 | 2009年02月11日 |
| 48 |  | ゼルダの伝説 大地の汽笛 | 74 | 任天堂 | 2009年12月23日 |
| 49 |  | めっちゃ！太鼓の達人DS 7つの島の大冒険 | 69.1 | ナムコ | 2008年04月24日 |
| 50 |  | レイトン教授と魔神の笛 | 67.1 | レベルファイブ | 2009年11月26日 |
